Hallo Felix,

zum mikroskopieren reicht ein winziges Lamellenstückchen. Dort findet man Sporen und andere spezifische Merkmale (Zystiden Basidien).
In der Regel ist der gesamte Pilz mehr oder weniger von den abgeworfenen Sporen "überpudert" (die Huthaut vielleicht ausgenommen).
Da Sporen gegen Umwelteinflüsse recht resistent sind, kann man sie auch aus dem Mageninhalt isolieren.

Gruß
Oktober